Kolejnym celem było skrócenie czasu wyłączania reaktora i usunięcie towarzyszącej temu dodatniej reaktywności poprzez: skrócenie czasu wprowadzania głównych prętów kontrolnych z 18 do 12 sekund; przeprojektowanie prętów kontrolnych; zainstalowanie systemu szybkiego opuszczania prętów, tzw. procedury BAZ – po wciśnięciu przycisku BAZ, pręty te opuszczały się szybciej niż 2,5 sekundy, podczas gdy inne w ok. 12 sekund. W przypadku wciśnięcia AZ-5, czas dla prętów BAZ wynosił ok. 7 sekund. wprowadzenie dodatkowych środków ostrożności przed nieupoważnionym dostępem do systemów bezpieczeństwa.
Reaktory RBMK zostały znaczniej zmodernizowane. Większe modyfikacje polegały na: wymianie kanałów paliwowych we wszystkich reaktorach oprócz Smoleńska 3; unowocześnieniu układu awaryjnego chłodzenia rdzenia; poprawieniu systemu ochrony przed kawitacją wysokociśnieniową reaktora; wymianie komputera procesowego.
Nowe koncepcje Na podstawie projektu RBMK stworzono nowy rodzaj reaktora nazwany MKER (ros. МКЭР, Многопетлевые Канальные Энергетические Реакторы, wieloobiegowy kanałowy reaktor energetyczny).