Od czerwca 2005 do stycznia 2007 zajmował stanowisko prezesa Fundacji Palli Karma-Sahayak, dużego funduszu, udzielającego mikrokredytów.

Premier 11 stycznia 2007 prezydent Iajuddin Ahmed wprowadził w kraju stan wyjątkowy i ogłosił odłożenie w czasie, zaplanowanych na 22 stycznia 2007 wyborów parlamentarnych„Bangladesh poll delay emergency”, BBC News, 11 stycznia 2007.. Ruch ten spowodowany był zamieszkami, jakie od października 2006 wybuchały między zwolennikami dwóch głównych partii politycznych„Bangladesh power shift postponed”, BBC News, 28 października 2006..

thumb|right|220px|Fakhruddin Ahmed, Pervez Musharraf, Hamid Karzaj w czasie Światowego Forum Ekonomicznego w Davos, 2008 12 stycznia 2007 prezydent Ahmed mianował tymczasowym premierem Bangladeszu Fakhruddina Ahmeda„Bangladesh president appoints head of a new caretaker government”, USA Today, 12 stycznia 2007.. Gabinet Ahmeda rozpoczął w kraju wielką akcję walki z korupcją. W tym celu powołał Komisję Antykorupcyjną.