Po rozpatrzeniu owego wniosku Rada Ministrów rozporządzeniem z dnia 26 września 1991 roku dokonała podziału Miasta i Gminy Mszana Dolna na dwie odrębne jednostki 1 stycznia 1992 r. thumb|Rynek w Mszanie 21 listopada 2009 r. kardynał Antonio Cañizares Llovera podpisał w imieniu Stolicy Apostolskiej dekret o nadaniu miastu patronatu św. Michała Archanioła.
28 września 2025 r. w kościele św. Michała Archanioła w Mszanie Dolnej abp Marek Jędraszewski przewodniczył uroczystościom odpustowym ku czci patrona tamtejszej parafii. Przy tej okazji metropolita krakowski ustanowił w świątyni Archidiecezjalne Sanktuarium św. Michała Archanioła.
Burmistrzowie Mszany Dolnej od 1990 r. Edward Liszka – 1990 (burmistrz Miasta i Gminy Mszana Dolna) Antoni Róg – 1990–1992 Tomasz Janik – 1992–1994 Antoni Róg – 1994–1998 Józef Kowalczyk – 1998–2006 Tadeusz Filipiak – 2006–2014 Józef Kowalczyk – 2014–2018 Anna Pękała – 2018–2024 Agnieszka Orzeł – od 2024
Kościoły i związki wyznaniowe mały|Sanktuarium św. Michała Archanioła Parafia rzymskokatolicka pw. Michała Archanioła Parafia rzymskokatolicka pw. Miłosierdzia Bożego Do 2012 roku w Mszanie Dolnej mieściła się Sala Królestwa Świadków Jehowy.