W 1962 ukazała się powieść Down There on a Visit, a w 1964 – Samotny mężczyzna, często uznawana za jego najlepsze dzieło. W 1966 wydawnictwo Simon & Schuster opublikowało zbiór opowiadań, recenzji i artykułów Isherwooda pt. Exhumations, a rok później ukazała się jego ostatnia powieść, A Meeting by the River. W 1971 roku pisarz wydał książkę Kathleen and Frank opowiadającą historię jego rodziny, a w 1976 ukazała się autobiografia Christopher and His Kind. Następna książka, October, była kolekcją portretów artysty Dona Bachardy’ego, do której Isherwood dopisał teksty.
W 1981 roku został u niego zdiagnozowany rak prostaty. Pisarz zmarł w 1986 roku w wieku 81 lat w swoim domu w Santa Monica. Jego ciało zostało przeznaczone Uniwersytetowi Kalifornijskiemu w Los Angeles do celów naukowych, a jego prochy zostały następnie rozrzucone nad morzem.
W 1997 roku Sharon Stone odkryła niepublikowane wcześniej opowiadanie Jacob’s Hands: A Fable, napisane kilkadziesiąt lat wcześniej we współpracy z Aldousem Huxleyem. Zostało ono wówczas oficjalnie wydane nakładem St. Martin’s Press. Od lat 90. zaczęły także ukazywać się dzienniki Isherwooda, zebrane w poszczególnych tomach przez znawczynię literatury Katherine Bucknell, a także jego prywatna korespondencja z Donem Bachardym.