Według Bennetta mógł on być wykorzystywany do przenoszenia już schwytanych ryb, ale nie nadawał się do ich chwytania. Pterodaktyle mogły uzupełniać dietę bezkręgowcami chwytanymi, gdy chodziły na czterech nogach po plażach i innych terenach nadbrzeżnych.
Klasyfikacja Pterosauria → Pterodactyloidea → Pterodactylidae
Gatunki thumb|250px|left|Rekonstrukcja Z pewnością do tego rodzaju można zaliczyć tylko jego gatunek typowy, Pterodactylus antiquus odkryty w Niemczech. Pterodactylus kochi generalnie jest uznawany za młodszy synonim P. antiquus; Vidovic i Martill (2011) uznają natomiast P. kochi za odrębny od P. antiquus gatunek i jednocześnie za gatunek typowy odrębnego rodzaju Diopecephalus Streszczenie wystąpienia. Peter Wellnoher (1970) wykluczył z rodzaju Pterodactylus opisane na podstawie nielicznych skamieniałości duże pterozaury "Pterodactylus" grandis i "Pterodactylus" grandipelvis, uznając, że oba te gatunki można jedynie sklasyfikować jako przedstawicieli Pterodactyloidea o niepewnej pozycji filogenetycznej;