Zawiera drobne, soczewkowate, gładkie i jasnobrunatne nasiona.
Biologia i ekologia thumb|Pokrój thumb|Bobrek trójlistkowy wśród roślinności torfowiska w rezerwacie Dury Bylina, geofit, hydrofit. Kwitnie od maja do czerwca. Zapylaczami są zwykle trzmiele. Nasiona rozprzestrzeniane są przez wodę.
Wymaga kwaśnych, torfiastych gleb. Rośnie na torfowiskach, mokrych i bagnistych łąkach, na młakach, na brzegach jezior i rowów. W Polsce w górach sięga po regiel dolny i najwyższe stanowiska ma w Gorcach. W klasyfikacji zbiorowisk roślinnych gatunek charakterystyczny dla klasy (Cl.) Scheuchzerio-Caricetea nigrae, All. Caricion lasiocarpae.
Liczba chromosomów 2n= 54.
Systematyka Pozycja systematyczna według APweb (aktualizowany system APG IV z 2016) Jeden z pięciu rodzajów z rodziny bobrkowatych (Menyanthaceae) z rzędu astrowców (Asterales). Pozycja w systemie Reveala (1993–1999) Gromada okrytonasienne Magnoliophyta Cronquist, podgromada Magnoliophytina Frohne & U. Jensen ex Reveal, klasa Rosopsida Batsch, podklasa astrowe Asteridae Takht., nadrząd Campanulanae Takht. ex Reveal, rząd bobrkowce Menyanthales T. Yamaz.