Ostatecznie także po korektach tabeli ze względu na ukaranie ujemnymi punktami Juventusu, A.C. Milan i Fiorentiny, Roma przesunęła się z 5. na 2. miejsce w tabeli stając się wicemistrzem kraju. Od tego czasu Mexès był podstawowym zawodnikiem Romy.
Na początku maja 2011 roku Mexès podpisał kontrakt z Milanem, który wzmocnił na zasadzie wolnego transferu przed sezonem 2011/12. Piłkarz występuje z numerem 5..
Sezon Klub Kraj Rozgrywki Mecze Bramki 1999/00 AJ Auxerre Ligue 1 5 0 2000/01 AJ Auxerre Ligue 1 32 0 2001/02 AJ Auxerre Ligue 1 30 3 2002/03 AJ Auxerre Ligue 1 34 1 2003/04 AJ Auxerre Ligue 1 32 3 2004/05 AS Roma Serie A 28 0 2005/06 AS Roma Serie A 27 3 2006/07 AS Roma Serie A 27 3 2007/08 AS Roma Serie A 31 1 2008/09 AS Roma Serie A 29 2 2009/10 AS Roma Serie A 18 1 2010/11 AS Roma Serie A 22 1 2011/12 A.C. Milan Serie A 14 0 2012/13 A.C. Milan Serie A 25 1 2013/14 A.C. Milan Serie A 22 2 2014/15 A.C. Milan Serie A 20 2 2015/16 A.C. Milan Serie A 5 1 Łącznie w Ligue 1 133 7 Łącznie w Serie A 243 16