Latem 1996 Pralija odszedł z Hajduka do Espanyolu Barcelona. Zagrał 24 mecze w sezonie, zdobył 3 bramki, a Espanyol zajął 14. miejsce w Primera División. W sezonie 1997/1998 Pralija w barwach Espanyol grał już mniej i na boisku pojawił się tylko 17 razy, a Espanyol skończył sezon na 10. miejscu w lidze. W rundzie jesiennej sezonu 1998/1999 Pralija zagrał jeden raz w La Liga i zimą wrócił do Hajduka.
W 1999 Pralija na pół roku trafił do włoskiej Regginy Calcio, której pomógł utrzymać się w Serie A. Pod koniec sezonu wrócił na krótko do Hajduka, a latem 2000 roku podpisał kontrakt z Maccabi Hajfa. Zdobył 6 bramek, a Maccabi zostało wicemistrzem kraju. Z Maccabi, podobnie jak wcześniej z Hajdukiem, zagrał w Lidze Mistrzów, w której strzelił bramkę w przegranym 1:2 meczu z Bayerem 04 Leverkusen.
Latem 2003 Pralija po raz kolejny wrócił do Hajduka. Zdobył dwukrotnie tytuł mistrza Chorwacji (w sezonie 2003/2004 zagrał 24 razy, zdobył 2 bramki, a w sezonie 2004/2005 16 razy strzelając 1 gola). Od 2006 do 2007 roku Pralija był zawodnikiem trzecioligowego klubu HNK Trogir, w którym zakończył karierę.