W jej skład wchodzą Biblioteka Główna, działająca na uczelnianym kampusie oraz biblioteki specjalistyczne mieszczących się w budynkach wydziałów: Ekonomiczna, Nauk Ścisłych i Przyrodniczych,Pedagogiczna, Prawnicza oraz Filii Uniwersytetu w Białymstoku w Wilnie.
Historia Utworzenie Biblioteki Uniwersyteckiej było konsekwencją powołania z dniem 1 października 1968 r. Filii Uniwersytetu Warszawskiego w Białymstoku. Początkowo placówka mieściła się w budynku przy ul. Mickiewicza 1 (dziś Wydział Prawa), gdzie dysponowała pomieszczeniami o powierzchni 475 m2 oraz czytelnią z 20 miejscami dla użytkowników. Wraz z rozwojem Filii następowała też rozbudowa Biblioteki, która w 1984 r. zajmowała już 1314 m2. Lokale nie były jednak przystosowane do funkcjonowania w nich czytelni i wypożyczalni. Dlatego już na początku lat 80. XX w. pojawiła się paląca potrzeba budowy dla Biblioteki odpowiedniego gmachu. Zrezygnowano jednak z tego pomysłu, kiedy w 1982 roku ówczesny Minister Nauki, Szkolnictwa Wyższego i Techniki wydał decyzję o przekazaniu na jej potrzeby Biblioteki części pomieszczeń powstającego Zakładu Elektronicznej Techniki Obliczeniowej przy ul. Skorupskiej 9.