A2000 posiadała pięć slotów kart rozszerzeń w standardzie Zorro II (transfer z procesorem z prędkością 2,5 MB/s), dwa z nich umieszczone były w jednej linii z 16-bitowymi slotami PC ISA, znajdowały się tam także dwa kolejne złącza ISA. Pozwalało to (przy zastosowaniu sprzętowego rozszerzenia) na wykorzystanie kart przeznaczonych do PC. Tego rodzaju sprzętowe rozszerzenia doczekały się implementacji procesora Intel 80486/50 MHz (produkty firmy Vortex serii Golden Gate, wyposażone w kontroler IDE i pamięć dla PC). A2000 posiadała także slot na kartę graficzną, w którym można było umieścić Video Toaster, flicker-fixer i inne specjalizowane urządzenia. W obudowie znajdował się zasilacz 220 W, zatoczka na urządzenie 5,25’’, i dwie zatoczki 3,5’’, z czego przynajmniej jedna z nich zawierała FDD FD (880 kB).
Od 1988 r. Commodore oferował też model Amiga 2000HD. Była to Amiga 2000 z zainstalowaną kartą rozszerzeń w slocie Zorro II o symbolu A2091, która zawiera kontroler SCSI i dysk twardy o pojemności 80 MB. W tym samym roku karta A2091 zaczęła być montowana także w Amidze 2500.
Do A2000 dołączano Workbench w wersji 1.3 lub 2.04 w ostatnich wersjach produkcyjnych.