W czasie wojny doszedł do stopnia porucznika.
W okresie międzywojennym pracował jako oficer sztabowy oraz instruktor. Służył również w szeregach Freikorps Epp i brał udział w zdławieniu powstania robotników w Zagłębiu Ruhry. Jako instruktor wojskowy odegrał pierwszorzędną rolę w przekształceniu Waffen-SS z jednostki paramilitarnej w oddziały szturmowe zdolne współdziałać z Wehrmachtem.
II wojna światowa thumb|Ferdinand Schörner w Bułgarii (1941) Schörner przysporzył Niemcom licznych sukcesów podczas kampanii wrześniowej, gdy dowodził 98 Pułkiem Górskim. Na jego czele 12 września 1939 próbował zdobyć z zaskoczenia Lwów, co jednak zakończyło się niepowodzeniem. Z 6. dywizją górską brał udział w kampanii francuskiej w przełamaniu frontu w Wogezach. W czasie działań na Bałkanach już w stopniu generała majora (awans w sierpniu 1940) podlegała mu 6 Dywizja Górska. Za swoją rolę w przełamaniu Linii Metaksasa został odznaczony Krzyżem Rycerskim. Dowodził też operacją zajęcia wąwozu Termopile. Przez kolejny rok Schörner pozostawał ze swoją dywizją.