Fiasko zakończyło udany okres w historii klubu – wymiana pokoleń spowodowała duże zmiany w składzie, sponsorzy mniej chętnie wspomagali finansowo klub, czego efektem jest jego obecna sytuacja.
W czerwcu 2007 klub pozyskał sponsora dla sekcji piłki nożnej – został nim producent urządzeń chłodniczych Igloo; reklama tej firmy już kilka sezonów wstecz widniała na koszulkach piłkarzy Bocheńskiego). Na sezon 2007/2008 BKS pozyskał kilku nowych zawodników, m.in. Michała Stolarza, byłego zawodnika zabierzowskiego Kmity, który w barwach kilku drużyn rozegrał ponad 110 spotkań w I lidze. Szkoleniowcem zespołu został wówczas wielokrotny reprezentant Hutnika Kraków i Górnika Zabrze w polskiej ekstraklasie (181 meczów w obu klubach w latach 1990–1996) Leszek Kraczkiewicz.
Od września 2007 trenerem drużyny był Marek Kusto – były piłkarz Wisły Kraków, Legii Warszawa i klubów z ligi belgijskiej, reprezentant Polski na MŚ 1974 i srebrny medalista MŚ 1982, jako trener prowadził m.in.