W treściach Indymediów przeważały tendencje anarchistyczne, antyglobalistyczne i kontrkulturowe oraz lewicowe.
Według zasad Indymediów lokalne zespoły były otwarte na inne lokalne organizacje pozarządowe walczące o wolność i inne fundamentalne prawa człowieka, tak aby nawet osoby pozbawione dostępu do Internetu mogły uczestniczyć w tworzeniu i odbiorze publikowanych treści.
Struktura Struktura Indymediów była niehierarchiczna, chociaż de facto istniały hierarchie wynikające z kontroli zasobów fizycznych (serwerów) czy finansowych. Wszyscy mogli publikować swoje informacje, każdy mógł także stać się uczestnikiem zespołów koordynujących lokalne IMC (zajmujących się np. usuwaniem spamu czy efektów internetowego wandalizmu) czy też podejmujących globalne decyzje o sieci IMC. W Indymedia nie mogły być zaangażowane partie polityczne czy inne grupy związane bezpośrednio z rządem lub korporacjami, chociaż ich członkowie mogli współtworzyć Indymedia.
W historii Indymediów zdarzyły się już na tym punkcie konflikty – m.in.