Głównym autorem dzieł studia Ghibli był Hayao Miyazaki, który po uznanej za arcydzieło Nausice stworzył Laputę – podniebny zamek (1986). Zapoczątkowała ona serię moralitetów Miyazakiego o odwołaniach religijnych i mitologicznych. Sławę twórca japoński zyskał za sprawą dokonującego wiwisekcji ludzkich postaw Mojego sąsiada Totoro (1988). Obserwację problemów dojrzewania prezentowała jego Podniebna poczta Kiki (1989), a w Szkarłatnym pilocie Miyazaki naśladował osiągnięcia postmodernizmu filmowego. Najgłośniejsze jego filmy: ukazująca katastrofę cywilizacji Księżniczka Mononoke (1997), hołd dla tradycji japońskiej Spirited Away: W krainie bogów (2003), czy analiza zagubienia tożsamości przez dojrzałą kobietę Ruchomy zamek Hauru (2004), cechowały się wyjątkowym nagromadzeniem emocji. Kolejna autorska produkcja Miyazakiego, Ponyo (2008), opowiadała o zetknięciu się „normalności” z „innością”.