EUMC publikuje dwa raporty roczne, z których pierwszy opisuje wyniki działalności EUMC w danym roku, drugi zaś dostarcza informacji na temat zjawiska rasizmu i ksenofobii we Wspólnocie i poszczególnych krajach członkowskich, uwypuklając przykłady dobrej praktyki (tzw. „good practices”). Centrum współpracuje ściśle z ONZ, OBWE, Parlamentem Europejskim, Komisją Europejską i działającą w ramach Rady Europy Europejską Komisją przeciwko Rasizmowi i Nietolerancji (ECRI) w dziedzinie zwalczania tych zjawisk.
Rada Zarządzająca Centrum obejmowała przedstawicieli Parlamentu Europejskiego, Komisji przeciwko Rasizmowi i Nietolerancji Rady Europy, Komisji Europejskiej oraz reprezentantów poszczególnych państw członkowskich UE. Centrum utrzymuje kontakt z administracją rządową państw członkowskich za pośrednictwem ekspertów łącznikowych (tzw. liaison officers). Ponadto Centrum opierało swoją działalność na sieci krajowych punktów kontaktowych (z ang. National Focal Points), które funkcjonowały w ramach Europejskiej Sieci Informacji o Rasizmie i Ksenofobii – RAXEN.