W 1963 jej matka poślubiła Danny’ego Guynesa, specjalistę handlowego reklam w dziennikach. Większość dzieciństwa i lat młodzieńczych spędziła w Perryopolis w stanie Pensylwania wraz z bratem Morganem (ur. 26 lipca 1967). Matka Moore i ojczym byli alkoholikami. Moore dorastała w domu, w którym rodzice nieustannie się kłócili, rozstawali i schodzili, a codzienne awantury były na porządku dziennym. Ich związek był na tyle burzliwy, że Moore miała w późniejszych latach problem z nawiązywaniem trwałych przyjaźni. Guynes, hazardzista, wielokrotnie w okresie jej dzieciństwa zmieniał pracę, co doprowadziło do przeszło 40 przeprowadzek rodziny. Młoda Moore miała problemy zdrowotne z nerkami i okiem, co wymagało dwóch operacji w celu poprawienia wzroku. W 1976 rodzina osiadła w Los Angeles. W 1980 jej ojczym popełnił samobójstwo.
Jako 15–latka została zgwałcona przez przyjaciela matki i obwiniając ją o to, wyprowadziła się z domu, porzuciła szkołę Fairfax High School w Los Angeles i rozpoczęła życie na własny rachunek. Mając 16 lat podjęła pracę jako modelka. W 1980 pozowała do serii nagich zdjęć, m.in. dla magazynu „Oui”. Zdjęcia te zostały opublikowane w czasopiśmie niemieckim, a później w Ameryce Północnej.