Wieś leży na Nizinie Śląskiej. Według podziału fizycznogeograficznego z 2017 dr. Krzysztofa Badory, Nowa Wieś Prudnicka znajduje się w granicach mikroregionu Równina Mosznej (318.55.9). W obszarze wsi przepływają potok Nowoprudnicki i struga Moszenna.
Na północ od miejscowości znajduje się las Kiernik oraz Czartowicki Las, a na południowy zachód las Piasek. W pobliżu wsi położona jest łąka o nazwie Pasternik. Od północy wieś sąsiaduje z rezerwatem wodno-leśnym Urszulanowice.
Ma charakter rolniczy.
Środowisko naturalne W Nowej Wsi Prudnickiej panuje klimat umiarkowany ciepły. Średnia temperatura roczna wynosi +8,3 °C. Duże zróżnicowanie dotyczy termicznych pór roku. Średnie roczne opady atmosferyczne w rejonie Nowej Wsi Prudnickiej wynoszą 614 mm. Dominują wiatry zachodnie.
Nazwa W Słowniku geograficznym Królestwa Polskiego z 1886 r. wieś jest notowana pod nazwą Nowawieś. W Spisie miejscowości województwa śląsko-dąbrowskiego łącznie z obszarem ziem odzyskanych Śląska Opolskiego wydanym w Katowicach w 1946 wieś wymieniona jest pod polską nazwą Nowa Wieś. 9 września 1947 nadano miejscowości nazwę Nowa Wieś PrudnickaRozporządzenie Ministrów: Administracji Publicznej i Ziem Odzyskanych z dnia 9 września 1947 r. o przywróceniu i ustaleniu urzędowych nazw miejscowości ()..