1950: Utworzenie Centralnego Biura Konstrukcji Okrętowych (CBKO) w Gdańsku. 1952: Podział na CBKO Nr 1 (statki cywilne) i CBKO Nr 2 (jednostki specjalne i wojenne). 1966: Przekształcenie CBKO Nr 1 w Centralny Ośrodek Konstrukcyjno-Badawczy Przemysłu Okrętowego (COKB PO). 1971: Powołanie Centrum Techniki Okrętowej (CTO) z połączenia COKB PO oraz CBKO Nr 2. W tym samym roku instytucja przejęła biurowiec „Zieleniak” w centrum Gdańska.
Rozwój po 1989 roku i komercjalizacja Okres transformacji ustrojowej przyniósł zmiany strukturalne i prawno-organizacyjne ośrodka:
1990: Powołanie Zakładu Badawczo-Rozwojowego (ZBR) CTO, koncentrującego działalność naukową jednostki. 1994: Udzielenie akredytacji PCA Laboratorium Badań Ogniowych 2002: ZBR CTO uzyskał formalny status jednostki badawczo-rozwojowej. 2004: Przekształcenie CTO w jednoosobową spółkę Skarbu Państwa pod nazwą Centrum Techniki Okrętowej S.A.
Infrastruktura badawcza i modernizacja (2008–aktualnie) W pierwszej i drugiej dekadzie XXI wieku ośrodek przeszedł intensywny proces modernizacji bazy technicznej oraz konsolidacji zasobów: