W słynącym z okazałych grabów (Carpinus betulus) lesie Bukta występują m.in. bluszcz pospolity (Hedera helix), jęczmieniec zwyczajny (Hordelymus europaeus) i groszek wschodniokarpacki (Lathyrus laevigatus). Wiosną kwitnie m.in. czosnek niedźwiedzi (Allium ursinum) i kokorycz pełna (Corydalis solida).
Fauna Na terenie rezerwatu odnotowano obecność ok. 2 tys. gatunków owadów (w tym rzadkich, m.in. czerwończyka nieparka (Lycaena dispar), przeplatki maturnej (Euphydryas maturna) i pływaka szerokobrzeżka (Dytiscus latissimus)), 5 gatunków gadów, 10 gatunków płazów (w tym chronionego kumaka nizinnego) oraz 45 gatunków ssaków, zaś w jeziorze Żuwinty żyją 22 gatunki ryb, w tym rzadki piskorz (Misgurnus fossilis). W lasach i na bagnach stale występują łosie (Alces alces), dziki (Sus scrofa), sarny (Capreolus capreolus) oraz wilki (Canis lupus), a brzegi jezior i rzek zamieszkują wydry (Lutra lutra) i gronostaje (Mustela erminea).
Żuwincki Rezerwat Biosfery stanowi jeden z najbogatszych pod względem awifauny obszarów na Litwie. Odnotowano 234 gatunki ptaków, w tym zarówno gatunki lęgowe, jak i wędrowne. Występuje tu m.in.