W 1943 r. został żołnierzem Armii Krajowej. Na Kielecczyźnie 1944 r. został oficerem 2 pułku piechoty Legionów AK. Pod pseudonimem,,Dick'' dowodził I plutonem i jednocześnie był zastępcą dowódcy 7. kompanii III batalionu 2. pułku piechoty Legionów AK. W Radkowie został ranny podczas starcia z Niemcami, do zdrowia dochodził w Mszanie Dolnej. W październiku 1944 r. wszedł w skład 6. kompanii II batalionu 1. pułku strzelców podhalańskich AK. Zostając zastępcą dowódcy ppor. Jana Stachury.
Podziemie i rzekoma współpraca z UB Po wkroczeniu w styczniu roku 1945 Armii Czerwonej do Małopolski początkowo ukrywał się lecz w marcu 1945 r. Zbigniew Kondal próbował się,,zalegalizować” pod fałszywymi personaliami w Rejonowej Komendzie Uzupełnień w Krakowie, niestety nie udało mu się to, został złapany i aresztowany. Został przewieziony do Warszawy, próbował wprowadzić w błąd funkcjonariuszy UB że chciałby z nimi współpracować, to dało by mu możliwość ucieczki, komuniści uwierzyli że dzięki niemu rozpracują struktury dowódcze AK i NSZ w woj. krakowskim, 9 czerwca 1945 Kondal podpisał formalne zobowiązanie i przyjął pseudonim „Pochmurny”. Dzięki temu ruchowi Kondal został wypuszczony 12 czerwca 1945 r.