W 1995 roku na bazie zespołu z inicjatywy Aleksandra Chasina utworzony został klub Nowaja Sibir, który w 1995 roku zdobył mistrzostwo Rosji. Skład zespołu stanowili Aleksandr Chalifman, Aleksandr Goldin, Konstantin Sakajew, Marat Makarow, Aleksandr Chasin, Aleksandr Fominych i Siergiej Rublewski. W Pucharze Europy Nowaja Sibir nie wyszła z grupy. Rok później zespół nie wystartował w mistrzostwach Rosji. W Pucharze Europy klub uzyskał trzecie miejsce, ulegając jedynie Tattransgazowi-Itilowi Kazań i ŠK Borovo-Vukovar '91. Działalność prowadził natomiast GSzK (Городской шахматный клуб, Gorodskoj szachmatnyj klub), który skoncentrował się na szkoleniu dzieci i młodzieży. W 2007 roku klub został przekształcony w DJuSSz.
Sibir został reaktywowany w 2015 roku z inicjatywy lokalnego związku szachowego oraz prezesa RATM Holding, Eduarda Tarana. Przyznano wówczas klubowi miejsce w Priemjer-Lidze, a zespół pozyskał natomiast takich zawodników, jak Władimir Kramnik i Lewon Aronian. W 2015 roku Sibir zdobył mistrzostwo Rosji, zwyciężając z trzypunktową przewagą nad drugim Uniwiersitiet Biełorieczensk. W tym samym roku zespół wystąpił w Pucharze Europy. W turnieju klub wygrał sześć spotkań, m.in.