Kandydowała w wyborach w 2001 do Sejmu IV kadencji z listy Ligi Polskich Rodzin w okręgu łódzkim (należała wówczas do Ruchu Katolicko-Narodowego). Mandat poselski uzyskała w 2004, wchodząc na miejsce wybranej do Parlamentu Europejskiego Urszuli Krupy. Od tego samego roku należała do LPR. W wyborach w 2005 została wybrana do Sejmu V kadencji.
24 marca 2006 Sejm wybrał ją na stanowisko rzecznika praw dzieckaUchwała Sejmu Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 24 marca 2006 r. w sprawie powołania Rzecznika Praw Dziecka ()., zaś 30 marca zgodę na objęcie przez nią stanowiska wyraził SenatUchwała Senatu Rzeczypospolitej Polskiej z dnia 30 marca 2006 r. w sprawie wyrażenia zgody na powołanie Rzecznika Praw Dziecka ().. Ślubowanie złożyła 7 kwietnia 2006.
W maju 2007 tygodnik „Wprost” zamieścił wywiad z Ewą Sowińską, w którym powiedziała ona o programie dla dzieci pt. Teletubisie, iż zauważyła, „że Tinky Winky ma damską torebkę, a dopiero „później się dowiedziała, że w tym może być jakiś ukryty homoseksualny podtekst”. Wywiad wywołał liczne reakcjeRzecznik praw dziecka Norwegii nazwał wypowiedź Ewy Sowińskiej homofobiczną, uznając ją za nakłaniającą do dyskryminacji z powodu orientacji seksualnej (zob. )..