W szczególności Komisja upoważniona była do: występowania do Prezydium Rady Ministrów z wnioskami o wyrażenie zgody na zgłoszone przez ministerstwa projekty zmian istniejącej organizacji administracji, występowania do Prezydium Rady Ministrów z wnioskami o wprowadzenie zmian w organizacji i metodach pracy administracji. Komisja zobowiązana była przedstawić Prezydium Rady Ministrów wniosków odnośnie do zgłoszonego projektu w ciągu dni 14 od daty wpływu projektu. Termin ten mógł być przedłużony za zgodą Prezesa Rady Ministrów.
Komisja mogła żądać od władz naczelnych informacji i wyjaśnień dotyczących organizacji i metod pracy aparatu administracyjnego. Mogła przeprowadzać stosowne badania na miejscu przez swoich przedstawicieli i mogła występować do tych władz z inicjatywą wprowadzenia zmian w istniejącej organizacji i metodach pracy.
Uprawnienia Komisji Komisja miała uprawnienia do opiniowania projektów wszelkich zmian istniejącej w organizacji władz, urzędów, instytucji i przedsiębiorstw państwowych, a w szczególności w przypadku utworzenia nowego urzędu centralnego lub jednostki organizacyjnej (stanowiska służbowego) w takim urzędzie na stopniu równorzędnym departamentowi lub wydziałowi w ministerstwie.