W związku z jego budową wyburzono apsydę kościoła, niszcząc pierwotny ołtarz główny oraz grobowiec Giuliana Adorno, męża Cateriny Fieschi Adorno. W 1556 roku na mocy decyzji Rządu Republiki zarządcy szpitala Pammatone mogli ponownie zająć część terenu, wywłaszczonego ze względów strategicznych, co z kolei umożliwiło odbudowę kościoła z zastrzeżeniem, że miał on być odległy od murów o co najmniej 26 palmDawna miara długości – odległość między kciukiem, a małym palcem (ok. 24 cm).. Odbudową apsydy zajął się Battista Grimaldi. Pod jej posadzką postanowił wznieść kryptę rodzinną, natomiast wykonanie fresków zlecił Giovanniemu Battiście Castello. Przez cały XVI wiek znamienite rody genueńskie zlecały najlepszym artystom dekorowanie kaplic kościoła. Battista Grimaldi zlecił wykonanie fresków w prezbiterium Giovanniemu Battiście Castello, a następnie Luce Cambiaso (u któremu już wcześniej zamówiono dekorację kaplicy Trzech Króli), natomiast wykonanie fresków i obrazów dla pozostałych kaplic powierzano lokalnym artystom, takim jak bracia Semino i Calvi. Do kościoła przeniesiono również ciało Cateriny Fieschi Adorno, spoczywające przedtem w kaplicy szpitalnej. W 1593 roku umieszczono je na emporze nad głównym wejściem.