11 marca 2002 rozpoczęto przygotowania terenu pod budowę kościoła. Zburzona została niedokończona szatnia klubu piłkarskiego LZS Pogórze i kaplica św. Rocha, z których cegły zostały wmurowane w nową świątynię. 23 kwietnia 2002 wykopano dół na piwnicę pod ołtarzem. 3 maja 2002 rozpoczęta została budowa kościoła. Do 13 maja postawiono ściany piwnicy, a 15 maja zalano jej sufit. 17 maja rozpoczęto kopanie fundamentów, a jedenaście dni później przystąpiono do ich zalewania. Na początku czerwca rozpoczęto murowanie ścian. 23 czerwca 2002 prałat Mikołaj Mróz wmurował kamień węgielny, poświęcony w 1983 podczas pielgrzymki Jana Pawła II na Górę Świętej Anny.
W 2003 wybudowano wieżę, a w 2004 wykonano dach. Pierwsza msza we wówczas jeszcze niedokończonym kościele została odprawiona w 2006 jako msza żniwna w intencji rolników. W tym samym roku w kościele celebrowano pasterkę. Budowa kościoła w Pogórzu zakończyła się w 2009. W tym samym roku obiekt został konsekrowany. Zgodnie z życzeniem arcybiskupa Alfonsa Nossola, świątynia została poświęcona Edycie Stein (Teresa Benedykta od Krzyża).
Architektura mały|lewo|Kościół od strony północno-wschodniej Projektantem kościoła był architekt Jan Oleniecki.