Muzea ujęte w wykazie muzeów Do muzeów wpisanych do wykazu muzeów, prowadzonego przez ministra właściwego do spraw kultury i ochrony dziedzictwa narodowego, zgodnie z art. 5b ustawy z dnia 21 listopada 1996 r. o muzeach należą: Wielkopolskie Muzeum Niepodległości z oddziałami: Muzeum Armii Poznań Muzeum Powstania Wielkopolskiego 1918–1919 Muzeum Uzbrojenia Muzeum Powstania Poznańskiego – Czerwiec 1956 ponadto muzeum udostępnia Przeciwatomowy Schron dla Władz Miasta Poznania Muzeum Martyrologii Wielkopolan – Fort VII Muzeum Bambrów Poznańskich Muzeum Historii Ubioru
Muzea łączone z instytucjami kultury Do muzeów łączonych z innymi instytucjami kultury, zgodnie z art. 5a ustawy z dnia 21 listopada 1996 r. o muzeach należą: oddziały Biblioteki Raczyńskich: Mieszkanie-Pracownia Kazimiery Iłłakowiczówny Muzeum Literackie Henryka Sienkiewicza Pracownia-Muzeum Józefa Ignacego Kraszewskiego Izba Pamięci Jerzego PertkaMuzeum udostępniane tylko w ramach prac naukowych. Dariusz Jędrzejewski, Poznań. Miasta dla ciekawych, Warszawa 2007, Wydawca: Hachette Livre Polska sp. z o.o., , s. 176.
Muzea kościelne Do muzeów kościelnych należą: Muzeum Archidiecezjalne w Poznaniu Muzeum Prowincji św.