Tworzy małe ryzomorfy często obecne w zbutwiałym drewnie i w obrzeżu owocnika.
Cechy mikroskopowe System strzępkowy monomityczny. Wszystkie strzępki ze sprzążkami, w subhymenium mają one szerokość 2,5–3,5 µm, są gęsto splecione, mniej lub bardziej wysycone kryształkami. Strzępki tramy są szersze, o średnicy 3-5 µm, luźniej splecione i rzadziej rozgałęzione, często. Pomiędzy strzępkami obficie występują kryształki o średnicy do 20 µm. Cystyd brak. Podstawki wąsko maczugowate, 18–28 × 4–5 µm z 4 sterygmami. Zarodniki wąsko elipsoidalne, 4–5,5 × 2–2,5 µm.
Występowanie i siedlisko Znane jest występowanie woskowniczka jamkowatego w Ameryce Północnej (w USA i Kanadzie), Europie, Azji i na Nowej Zelandii. W Polsce do 2003 r. znane było 7 stanowisk i to już historycznych (1889–1963). W. Wojewoda uznał go za gatunek w Polsce wymarły. W Czerwonej liście roślin i grzybów Polski w 2006 r. ma status E – gatunek wymierający, którego przeżycie jest mało prawdopodobne, jeśli nadal będą działać czynniki zagrożenia. Znaleziono nowe stanowiska. Podaje je m.in.