Po opuszczeniu Borui Kościelnej i okolic przez ludność niemiecką w styczniu 1945 roku, rozpoczęło się porządkowanie kościoła poewangelickiego, które zostało zakończone w maju tego samego roku. W dniu 11 maja 1945 roku świątynia została poświęcona i odprawiono w niej pierwsze nabożeństwo majowe, któremu przewodniczył proboszcz z Nowego Tomyśla, ks. Stanisław Skaziński. Dokładano wszelkich starań, aby kościół pełnił funkcję kościoła parafialnego. Na ten dzień mieszkańcy Borui Kościelnej jednak musieli poczekać jeszcze parę lat. Po 1945 roku dzięki ofiarności mieszkańców wsi, którzy ufundowali szaty liturgiczne, mszał oraz obrusy, mogły odbywać się cotygodniowe msze święte, którym przewodniczył ks. Michał Kosicki, ówczesny proboszcz z Nowego Tomyśla. Zygmunt Nowak ufundował obraz do ołtarza głównego, natomiast z pieniędzy ofiarowanych przez repatriantów została kupiona płaskorzeźba Matki Boskiej Ostrobramskiej.
Parafia świętego Wojciecha w Borui Kościelnej została erygowana 15 listopada 1948 roku. Wtedy z rąk ks. arcybiskupa metropolity Walentego Dymka na proboszcza parafii został mianowany, wprowadzony kilka miesięcy wcześniej bo 10 marca 1948 roku, ks.