Magazyn nadal koncentrował na pracy Toriyamy przez większość lat 90., jednak w latach 2000. zaczęto promować inne franczyzy Shūeishy, które od tej chwili otrzymywały własne gry komputerowe i inne formy mediów. To spowodowało, że V Jump często był używany jako forma promocji, a jego okładki niekoniecznie odzwierciedlały jego zawartość. Na wielu okładkach pojawiały się takie postacie, jak Luffy czy Naruto, mimo że czasopismo nigdy nie publikowało mang One Piece i Naruto. Zostało to zmienione przez wspólny magazyn V Jump i Weekly Shōnen Jump, kiedy w 2010 roku powstał Saikyō Jump, który połączył tematykę V Jump z mangowymi spin-offami popularnych serii Shōnen Jump. W listopadzie 2020 roku komik Kendo Kobayashi został oficjalnie mianowany redaktorem V Jump.
Mimo że magazyn nadal koncentrował się na Dragon Ball, to od czasu zakończenia w Shōnen Jump oryginalnej serii Yu-Gi-Oh! V Jump stał się głównym rynkiem zbytu dla tej serii, w wyniku czego pojawiały się w nim wszystkie oficjalne spin-offy (Yu-Gi-Oh! GX, Yu-Gi-Oh! R), często dwa lub trzy jednocześnie. W V Jump pojawiło się również kilka serii, które były publikowane w Weekly Shōnen Jump, m.in. Shadow Lady stworzone przez Masakazu Katsurę, Go! Go!