Dorobek naukowy Zenona Wachnika liczy ponad 200 prac, z czego większą część stanowią opracowania dotyczące patologii drobiu. Wprowadził system doszkalania drobiarzy przez organizowanie co 3 lata sympozjów drobiarskich oraz doprowadził do uruchomienia na Akademii Rolniczej we Wrocławiu podyplomowego studium technologii chowu, profilaktyki i zwalczania chorób w wielkotowarowym drobiarstwie. Zenon Wachnik był kuratorem ZSP, w latach 1966-1974 pełnił funkcję prorektora Akademii Rolniczej we Wrocławiu, był wiceprzewodniczącym Zespołu Dydaktyczno-Wychowawczego przy Ministerstwie Nauki, Szkolnictwa Wyższego i Techniki oraz członkiem Międzyuczelnianego Ośrodka Metodycznego Akademii Rolniczej we WrocławiuElżbieta Lonc, Anna Okulewicz XVII Wrocławska Konferencja Parazytologiczna „Pro memoriam — Wrocławska Szkoła Parazytologii wczoraj i dziś”, 24 listopada 2006 Wiadomości Parazytologiczne 2007, 53(4), s. 359–375.
Zmarł w 1981, pochowany na cmentarzu w Czarnocinie, k. Piotrkowa Trybunalskiego.