Biotopy i hydrologia Rezerwat chroni największą w Europie rzeczną równinę zalewową, która zachowała się w pierwotnym stanie. W jego granicach znajdują się lasy łęgowe z dominującymi drzewostanami dębowo-olszowymi oraz łąki od bagiennych po grądowe, w tym szczególnie łąki łęgowe. Na obszarze ochrony występują także bagna i jeziora. Ważnymi biotopami są starorzecza i samo koryto Prypeci oraz wpadających do niej rzek.
Prypeć i jej dopływy należą do rzek nizinnych. W jej środkowym biegu charakterystyczne są wiosenne powodzie, podczas których woda zalewa równinę zalewową przez 3,5 do 4 miesięcy przy Prypeci i przez 40-45 dni przy mniejszych rzekach. Latem stan wód jest niski, jednak zdarzają się powodzie, niekiedy przybierające katastrofalne rozmiary, gdy woda zalewa osady ludzkie.
Na terenie Rezerwatu Krajobrazowego Środkowa Prypeć do Prypeci uchodzą m.in. (w kolejności według biegu rzeki): Jasiołda, Styr, Bobryk Pierwszy, Cna, Śmierć, Horyń, Łań, Słucz i StwihaGoogle Maps.