Nie istnieje obecnie szczepionka, ani forma terapii zdolna wyleczyć dotknięte pszczoły, więc higiena jest najlepszym sposobem zapobiegania rozprzestrzenianiu wirusa. Do praktyk sanitacyjnych należy wymiana plastra i wymiana królowej na zdrową.
Klasyfikacja BQCV należy do rzędu Picornavirales Rodziny rodziny w tym rzędzie to include Picornaviridae, Comoviridae, Dicistroviridae, Marnaviridae, oraz Sequiviridae. BQCV należy do Dicistroviridae, co oznacza, że jest wirusem stawonogów. Do rodziny tej należy 12 wirusów z rodzaju Cripavirus, oraz inne z rodzajów Aparavirus i Triatovirus.
Struktura Wirus czarnych mateczników zawiera 60 kopii białek kapsydowych VP1, VP2 i VP3. Kapsyd jest zewnętrzną powłoka wirusa, zawierającą jego materiał genetyczny. Białka VP4, które czasem w nim występują, nie maja wpływu na jego zaraźliwość, ani zdolność transmisji. Powierzchnia wirionu ma duże wypustki złożone z VP1 i VP3, zlokalizowane pomiędzy 5- i 3- krotnymi osiami dwudziestościennego kapsydu, złożonego z trójkątnych ścian ułożonych w bryłę przypominającą sferę. Osie znajdują się na stykach tych ścian.
Z racji obecności tych wypustek, BQCV jest większy niż większość picornawirusów. Kapsyd posiada też płaskowyże wokół osi 3-krotnych i zagłębieniami wokół osi dwukrotnych.