Podejmuje działania na rzecz dzieci, osób chorych i ich rodzin, ochrony zdrowia, edukacji, pomocy społecznej, kultury oraz przeciwdziałania problemom społecznym.
Fundacja publikuje materiały edukacyjne, w tym poradniki i podręczniki dla rodziców (m.in. Dziecko z wadą serca – poradnik dla rodziców). Realizuje też własne projekty: organizuje konferencje, szkolenia, turnusy rehabilitacyjne, udziela pomocy psychologicznej, uczestniczy w kampaniach społecznych i akcjach charytatywnych. Współpracuje ze szkołami, zachęcając ich uczniów do udziału w akcjach charytatywnych. Fundacja Serce Dziecka interweniuje i lobbuje w kwestiach związanych z leczeniem dzieci z wadami serca.
Fundacja Serce Dziecka w 2017 została wyróżniona tytułem Lidera Medycyny w Konkursie „Sukces Roku w Ochronie Zdrowia” za cykl charytatywnych koncertów muzyki klasycznej „Otwarte Serca – Mistrzowie Muzyki, Biznesu i Kardiochirurgii Dzieciom”. Projekt łączył świat artystów polskiej muzyki klasycznej, polskiego biznesu oraz kardiochirurgii dziecięcej.