W roku 2020 dane ankiety CID Gallup wykazały, że 44% mieszkańców identyfikuje się z Kościołami protestanckimi nurtu ewangelikalnego (ok. 2 mln 900 tys. obywateli). Przynależność do Kościoła rzymskokatolickiego deklaruje 38%. Spośród badanych 55% to osoby, które urodziły się i zostały ochrzczone w Kościele rzymskokatolickim.
Historia Do 1525 roku Pedro de Alvarado, jeden z najokrutniejszych hiszpańskich konkwistadorów, ujarzmił – z ogromną brutalnością – większość rdzennej ludności Ameryki Środkowej. Terytorium Salwadoru w hiszpańskim okresie kolonialnym weszło w skład kapitana generalnego Gwatemali i przez pewien czas po odzyskaniu niepodległości było częścią federalnej Republiki Ameryki Środkowej (1821–1838), aż do uzyskania pełnej niepodległości w 1838 roku.
Pojawienie się w latach 60. XX wieku, wielu protestanckich agencji misyjnych (głównie ze Stanów Zjednoczonych) podważyło historycznie dominującą pozycję Kościoła rzymskokatolickiego w Salwadorze.
Inne mały|200x200px|Mormońska świątynia w San Salvador Oprócz szybkiego wzrostu wyznań ewangelicznych, w ciągu ostatnich kilku dziesięcioleci, Salwador był także świadkiem pojawienia się licznych mniejszych grup wyznaniowych, takich jak: Świadkowie Jehowy, Kościół Jezusa Chrystusa Świętych w Dniach Ostatnich (mormoni), czy też La Luz del Mundo z Meksyku.