Małżeństwo z Böhmerem 15 czerwca 1784 wyszła za mąż, za Johanna Franza Wilhelma Böhmera (1754–1788), syna prawnika, Georga Ludwiga Böhmera. 28 kwietnia 1785 para doczekała się pierwszego dziecka, córki – Auguste Böhmer, do której mówiono – Gustel. 23 kwietnia 1787 przyszła na świat ich druga córka, Therese Böhmer, którą nazywano pieszczotliwie Różyczką. 4 lutego 1788, gdy Böhmer była w trzeciej ciąży, zmarł jej mąż. Po jego śmierci Böhmer przeprowadziła się z córkami do swoich rodziców. Tam urodziła w 1788, w sierpniu syna – Wilhelma, który zmarł po kilku tygodniach. W 1789 Böhmer przeprowadziła się wraz z córkami do swojego przyrodniego brata, profesora medycyny Christiana Friedricha Michaelisa – nazywanego Fritzem – do Marburga. 17 grudnia 1789 zmarła jej najmłodsza córka, Therese. W 1789 Böhmer przeprowadziła się ze swoją najstarszą córką do Getyngi.

Najważniejszy okres jej życia rozpoczął się po śmierci jej pierwszego męża podczas pobytu w Moguncji, gdzie wybuchła rewolucja francuska w 1792. W czasie rewolucji Böhmer poznała niemieckiego Jakobina, Georga Forstera. Oboje intensywnie zajmowali się ideami i politycznymi celami rewolucji.