O powrocie do tradycji Prywatnego Męskiego Gimnazjum im. Stefana Batorego zdecydowano w 1989 roku – szkołę reaktywowano jako „Pierwsze Społeczne Liceum Ogólnokształcące im. Stefana Batorego” w dniu 24 sierpnia 1990 r. Pierwszą tymczasową siedzibą został prywatny budynek przy ul. Staszica 14. W 1991 roku liceum zostało przeniesione do domu parafialnego przy kościele Księży Pallotynów, mieszczącego się przy al. Warszawskiej 31. 28 października 1995 szkoła zmieniła nazwę na „Pallotyńskie Liceum Ogólnokształcące im. Stefana Batorego”, co było związane z przekazaniem placówki Stowarzyszeniu Apostolstwa Katolickiego. W 1999 działalność rozpoczęło Pallotyńskie Gimnazjum im. Stefana Batorego.
Wskutek reformy systemu oświaty z 2017 roku placówka została przekształcona w Publiczną Szkołę Podstawową im. św. Wincentego Pallottiego – liceum i gimnazjum uległy wygaśnięciu i ostatecznie przestały istnieć w 2019 roku.
Dyrektorzy Ksawery Franciszek Służewski (1906–1907) Józef Arlitewicz (1907– †13 IV 1930) Zygmunt Kukulski (od 1931)