W 1575 papieski wysłannik Pietro Dusina, w raporcie z wizyty określił to miejsce jako Xagħra l-Fuqanija tal-Qassis. Świątynia miała jeden ołtarz, drewniane drzwi i podłogę. Kaplica nie miałe rektora ani dochodów, jednak Salvatore Montagnere, uprawiający pole zwane Ħabel ix-Xiħ, był zobligowany do zapewnienia wszystkiego na dzień święta patronalnego kaplicy.
Kiedy około pięćdziesiąt lat później, w latach trzydziestych XVII wieku, biskup Baldassare Cagliares wizytował kaplicę, znalazł ją w dobrym stanie; kaplica miała opiekuna, była wewnątrz pomalowana i miała wyłożoną płytami podłogę. W kaplicy było aspersorium, kilka starych obrazów oraz wyposażenie potrzebne do sprawowania mszy świętej. Nad ołtarzem znajdował się obraz tytularny Zwiastowanie, ufundowany przez rycerza Giacomo Christoforo ab Andlau.
W latach 1680–81, kiedy wielkim mistrzem zakonu joannitów był Gregorio Carafa, zaś biskupem Malty Miguel Jerónimo de Molina, kaplica została przebudowana. Śladem tego są m.in. herby wielkiego mistrza i biskupa ponad drzwiami do zakrystii, co ujęte jest w raporcie biskupa Davide Cocco Palmieri z wizyty w 1699. Szlachetny Adobaldo Testaferrata Abela 8 lutego 1682 podarował kaplicy nowy obraz tytularny Zwiastowanie.