mały|250px|Logo SNPedii SNPedia (wymawiana: „snipedia”) – oparta na mechanizmie wiki strona internetowa o bioinformatyce, będąca bazą danych na temat polimorfizmu pojedynczych nukleotydów (SNP). Każdy artykuł na temat SNP zawiera krótki opis, linki do artykułów naukowych i stron o genomice osobistej, oraz opis mikromacierzy danego SNP. SNPedia może pomóc w interpretacji wyników genotypu danej osoby otrzymanych np. z firm 23andMe, Navigenics, deCODEme czy Knome.
SNPedia to semantyczna wiki, stosująca oprogramowanie MediaWiki z rozszerzeniem .
SNPedia została stworzona i jest prowadzona przez genetyka Grega Lennona i programistę Mike’a Cariaso, zamieszkałych wówczas w Bethesda w stanie Maryland.
We wrześniu 2011 w bazie danych strony było prawie 25 000 SNiPów. Od sierpnia 2007 liczba SNiPów w SNPedii podwajała się co około 14 miesięcySNPedia: a wiki supporting personal genome annotation, interpretation and analysis, Michael Cariaso and Greg Lennon, Nucleic Acids Research, 2011, 1–5.
Promethease Zespół pracujący przy SNPedii stworzył też bezpłatne oprogramowanie Promethease, przy użyciu którego użytkownicy mogą porównać wyniki uzyskane w bazie danych SNPedii, i wygenerować raport z informacjami o cechach danej osoby, np. skłonność do chorób, na podstawie obecności danego SNiPu w jej genomie.
W maju 2008 Michael Cariaso, używając programu Promethease, wygrał konkurs online sponsorowany przez 23andMe, polegający na określeniu jak największej ilości informacji o anonimowej kobiecie, bazując jedynie na jej genomie. Cariaso wygrał we wszystkich trzech kategoriach, którymi były: „dokładność, kreatywność i spryt”And the Winner Is..., Matthew Crenson, The Spittoon, May 14, 2008. W 2009 ową anonimową kobietą („Lilly Mendel”) okazała się być współzałożycielka 23andMe, Linda Avey, pozwalając porównać bezpośrednio jej cechy z cechami przewidzianymi na podstawie programu Promethease rok wcześniej.
Odzew W czerwcowym artykule o genomice osobistej z 2008 lekarz z Southern Illinois University School of Medicine powiedział:
W styczniu 2011 dziennikarz technologiczny Ronald Bailey opublikował w Internecie pełne wyniki swoich danych z Promethease. Swoją decyzję na łamach miesięcznika libertariańskiego Reason umotywował następująco:
Zobacz też Mendelian Inheritance in Man Genomika
Przypisy
Linki zewnętrzne SNPedia Promethease http://www.genome.gov/GWAStudies , Webcast z Bio-ITWorld.com.
Kategoria:Biologiczne bazy danych Kategoria:Przedsiębiorstwa biotechnologiczne Kategoria:Wiki